1988-民國77年 | 日間部五專部成立
1996-民國85年 | 本校校名更名為”嘉南藥理學院”，增設日夜二技部
1998-民國87年 | 五專部停招
1999-民國88年 | 二專部停招、增設日夜四技部
2000-民國89年 | 本校校名更名為”嘉南藥理科技大學”
2004-民國93年 | 設立醫療資訊管理研究所
2006-民國95年 | 增設進修學院二技部、研究所在職專班
2008-民國97年 | 日間部二技停招、進修部四技停招
2009-民國98年 | 進修部二技停招 ，系所合一更名為醫務管理系(碩士班含在職專班)
2010-民國99年 | 進修部二技 與四技恢復招生
2018-民國107年|進修部二技停招
2019-民國108年|進修部四技停招
2023-民國112年|進修部二技恢復招生
本系教育目標為提供完備之醫療產業管理專業訓練，培育學生具備專業管理知識、解決問題能力及
熟悉資訊應用技能，並培養同學兼具管理領導之人文素養與人際溝通能力，以瞭解社會環境變遷、順應
人工智慧科技發展趨勢以及醫療服務產業需求，並協助醫療暨健康相關產業提供高品質、高效率之健康照護與預防保健服務，促進
國人健康。
1.培育學生成為基層與中階醫療服務產業管理優秀人才。
2.培育學生具備醫療服務產業管理的專業知識。
3.培育學生具備行政事務與資訊科技應用的實務操作技能。
4.培育學生具備尊重生命、社會服務與人文法治的基本素養。
5.培育學生具備溝通協調與問題解決之基本能力。
6.培育學生具備專案企劃管理、健康服務行銷、行政事務處理之實務操作技能。
1.培育學生成為高階醫療服務產業管理優秀人才。
2.培育學生具備需求分析、獨立思考與問題解決的能力。
3.培育學生具備整合、創新與策略規劃的專業能力。
4.培育學生具備宏觀國際視野與領導溝通協調的才能。